Caracterización de los perfiles de expresión del factor de transcripción Ikaros en enfermedades autoinmunes

Abstract

ANTECEDENTES: Las enfermedades autoinmunes son síndromes en los que existe una respuesta inmune (activación de linfocitos T yo B y producción de anticuerpos) dirigida contra antígenos propios. Son patologías complejas con gran variedad de genes asociados, sin embargo éstos no explican completamente todos los trastornos. Ikaros es un factor de transcripción linfoide con un rol indirecto en la producción del interferón. En este estudio caracterizamos el perfil de expresión de las regiones interexónicas del gen Ikaros en pacientes con diagnóstico de Síndrome de Sjögren (SS), Lupus Eritematoso Sistémico (SLE), Esclerosis Sistémica (SSe) y Artritis Reumatoide (RA). MÉTODOS: Se tomaron muestras de sangre periférica y se extrajo RNA. Se llevó a cabo un nuevo de diseño de qRT-PCR que consistió en la amplificación de cada región interexónica de Ikaros y la detección de splicing no canónico se realizó mediante el análisis de las curvas de disociación melting. Para la cuantificación relativa se utilizó el software REST 2009 2.0.13 y el análisis estadístico se basó en los test Kruskal-Wallis, de Dunn y de Wilcoxon. El análisis de agrupación jerárquica se realizó con los programas Cluster 3.0 y Java Treeview 1.1.6r2. RESULTADOS: Al igual que previamente se había demostrado un desequilibro de isoformas en distintas malignidades hematológicas, la expresión del factor de transcripción Ikaros también se encuentra alterada en enfermedades autoinmunes. En todas las regiones Interexónicas hubo diferencias significativas entre los grupos de comparación, excepto para IK 5-6. La expresión disminuida de la región IK4-5 en todas las patologías autoinmunes se asoció con la presencia de isoformas dominantes negativas. En los pacientes con SLE se observó una expresión reducida de Ikaros Indicando que ésta podría ser una posible causa de la enfermedad. Las variantes de splicing detectadas afectan los exones con dominios de unión al ADN y de interacción con otras proteínas. En cuanto diferencias de expresión según el sexo no es posible obtener una conclusión definitiva debido a la baja proporción de hombres en el estudio