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dc.contributor.advisorDuitama Castellanos, Jorge Alexander
dc.contributor.authorTello Velasco, Daniel
dc.date.accessioned2020-06-10T09:32:31Z
dc.date.available2020-06-10T09:32:31Z
dc.date.issued2018
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/1992/35046
dc.description.abstract"En este trabajo presentamos una nueva solución de software para el alineamiento de genomas completos a través de la identificación eficiente de bloques sinténicos construidos a partir de cadenas largas de genes ortólogos. En contraste con herramientas clásicas que construyen alineamientos basados solamente en secuencias similares, las cadenas de ortólogos permite el alineamiento entre cromosomas y genomas muy grandes en solo minutos, con pocos procesadores y 8Gb de memoria RAM. Nuestra solución fue comparada contra algunas de las herramientas más comunes para hacer genómica comparativa, requiriendo significativamente menos tiempo y recursos computacionales para procesar genomas de gran tamaño. Adicionalmente, usando tecnologías de visualización de última generación, proporcionamos vistas novedosas e interactivas del alineamiento generado por nuestro software. Esperamos que este desarrollo represente una contribución importante al campo de la genómica comparativa, facilitando descubrimientos en evolución, genómica funcional y campos relativos." -- Tomado del Formato de Documento de Grado.es_CO
dc.description.abstract"Here we present a new software solution for alignment of complete genomes through the efficient identification of synteny blocks built from large chains of orthologous genes. In contrast with classical tools that build alignments based on raw sequence similarities, ortholog chains enable alignments between chromosomes of large genomes within minutes of computation, requiring fewer processors and less than 8Gb of RAM. Our newly developed solution was benchmarked against some of the most common tools for comparative genomics, taking significantly less time and resources for the processing of larger genomes. Additionally, using state-of-the-art data visualization technologies, we provide novel interactive views of the alignments provided by our software. We expect that this development represents a significant contribution to the field of comparative genomics facilitating further discoveries in evolution, functional genomics and related fields." -- Tomado del Formato de Documento de Grado.es_CO
dc.formatapplication/pdfes_CO
dc.format.extent24 hojases_CO
dc.language.isoenges_CO
dc.publisherUniandeses_CO
dc.sourceinstname:Universidad de los Andeses_CO
dc.sourcereponame:Repositorio Institucional Sénecaes_CO
dc.titleDevelopment of a software solution for genome alignmentes_CO
dc.typeTrabajo de grado - Maestríaspa
dc.publisher.programMaestría en Biología Computacionales_CO
dc.subject.keywordGenómica comparativa - Programas para computador - Investigacioneses_CO
dc.subject.keywordBiología computacional - Investigacioneses_CO
dc.subject.keywordGenómica - Procesamiento de datos - Investigacioneses_CO
dc.subject.keywordComplejidad computacional - Investigacioneses_CO
dc.subject.keywordAlgoritmos genéticos - Investigacioneses_CO
dc.publisher.facultyFacultad de Cienciases_CO
dc.publisher.departmentDepartamento de Biologíaes_CO
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/mastherThesisspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionspa
dc.description.degreenameMagíster en Biología Computacionales_CO
dc.description.degreelevelMaestríaes_CO
dc.identifier.instnameinstname:Universidad de los Andesspa
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Sénecaspa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccspa
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaspa
dc.type.contentTextspa
dc.type.redcolhttp://purl.org/redcol/resource_type/TMspa
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa


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